【NGS Introduction Series-Mybaits Custom DNA target enrichment design】

Date: 2024-5-3

Hybridization capture又稱為Target enrichment,為次世代定序 (NGS)所使用的方法之一。DNA樣本先進行文庫 (Library)建構,接著與帶有biotin標記的RNA探針 (Probe)進行雜交作用 (Hybridization) ,探針會辨識並黏合DNA片段上的互補序列,再利用帶有streptavidin的磁珠純化分離出探針所捕獲的DNA片段,最後將這些純化分離出的DNA片段進行PCR擴增,即可進行後續的定序及分析。

Hybridization capture的方法只針對富集 (Enrichment)後的目標區域進行定序,能夠大幅降低每個樣本定序的成本費用,並提高了定序效率。myBaits Custom DNA-Seq即利用此原理為基礎提供了客製化的探針及試劑,快速地進行DNA目標區域的富集,並且後端的定序實驗可接續並相容於各NGS平台,包括Illumina、Oxford Nanopore及PacBio…等。

myBaits Custom DNA-Seq使用最新一代經優化後的探針,利用Daicel Arbor Biosciences公司的專利寡核苷酸 (oligo)合成技術,稱為 ”v5” 化學原理,可以使探針作用達到最佳的DNA富集效果。原廠並且提供客製化探針設計的服務,客戶只要提供序列 (FASTA檔案格式)或是序列在基因組中的位置 (BED檔案格式)即可代為設計探針。此外,提供的序列中可以含有複合鹼基 (ambiguous bases),但比例不能超過5~7%。

由於myBaits Custom DNA-Seq使用客製化設計的探針,所以各物種都能適用,包括動物、植物、微生物皆可使用;並且也適用於短片段或是已產生降解的樣本,例如可應用於考古學的古生物樣本或cell-free DNA等。因此myBaits Custom DNA-Seq對於有著明確定序目標區域的NGS樣本提供了最好的解決方案。

Next Generation Sequencing (NGS) Sequencing Service


1. Nanopore and Illumina offer a complete range of sequencing platforms for long and short sequences.
2. An excellent choice for high efficiency and quality.
3. Professional sample quality control processes and library preparation.
4. Professional bioinformatics analysis and service consultation.