單細胞RNA定序(Single cell RNA Sequencing; scRNA-seq)是一種利用次世代定序的方法對單一細胞mRNA進行擴增及定序的技術。

單細胞RNA定序的原理在此介紹的是使用微流體裝置進行油滴乳化封裝(oil emulsion encapsulation)方法產生微滴(droplet)：

如下圖所示，裝置有三個通道：分別為細胞(Cell)、微粒(microparticle with lysis Buffer)、油(Oil)，之後利用微流體的技術讓細胞與微粒先匯合，

再流經含有油的通道時，細胞微粒混合體就會被油滴一個一個的包埋，

以一個細胞搭配一個微粒的組合形成各自獨立的微滴(droplet)。

含有Poly A的mRNA細胞先與裂解緩衝液(Lysis buffer)中鑲嵌著DNA primer的微粒(microparticle)會合，

其結構為包含poly T、Cell barcode、UMI barcode以及PCR handle fragment之微粒

此時將細胞裂解，其中所含mRNA會釋出，此droplet內的微粒會與mRNA結合(PolyT 與mRNA的 polyA)

隨後打破微滴，再進行反轉錄RT、cDNA PCR、及Library文庫的程序。

文庫完成之後，每個細胞的library都會包含不同的barcode序列，

定序分析時便可透過這些序列去區分單一細胞或多細胞、

以及計算單一細胞中的RNA表現狀況。

欲知關於Single Cell數據分析的內容，

請見下回分曉~~

#Single-Cell-Sequencing

#Nadia-Instrument

#RNA-Sequencing

#源資國際生物科技股份有限公司

#TriIBiotech