單細胞定序(Single Cell Sequencing)是一種利用次世代定序的方法，

有別於傳統的定序使用多數細胞來分析，

針對逐顆分離出的單一細胞進行DNA或RNA定序，

可以得知每個細胞原始的序列差異、細胞型態、以及細胞特異性......等

因此，透過單一細胞的定序，

可以得知單一細胞的類型及單一細胞的基因表現，

進而去探討細胞間分子機制的優勢......等。

近年來，單細胞定序在臨床的應用越來越為主流，

例如：探討腫瘤發生與轉移的機制，就與單一細胞的特定基因表現密切相關。

或進行人工生殖時胚胎著床前基因篩檢（Preimplantation Genetic Screening，PGS/PGT-A/PGD/PGT-M)

其他的熱門領域應用還有像是微生物學領域、神經學疾病領域、生殖醫學領域、免疫學領域、消化和泌尿系統領域、藥物學領域......等。

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