【NGS Introduction Series- Immune profiling CDR analysis 】
CDR (Complementarity-determining region)為抗體 (Antibody)及T cell receptors上變異區域的一部分，為抗體跟抗原 (Antigen)接觸的區域。此變異區域有三個不同的CDR胺基酸序列 (CDR1、CDR2及CDR3)。其區域座落於Antibody的Light-chain及Heavy-chain上 (圖一)。CDR的變異度很大，主要是為了能夠捕捉不同種類的抗原，以便能夠進行特定的免疫反應。不同的CDR組合將決定抗體對抗原的結合活性，因此在研究找出針對目標抗原的最佳抗體實驗中，需要能準確鑑定出其CDR的序列，以便能夠準確得到正確的抗體結合區域資訊。
針對CDR區域透過次世代定序的方法進行定序，所獲得的測序資料進行Merge後使用IMGT (https://www.imgt.org/)進行CDR的區域分析，並結合內建的資料庫資訊進行CDR的偵測及註解 (圖二)，獲得其胺基酸的序列。之後更進一步將所有獲得CDR序列進行統計，可以繪製Bar chart (圖三) 或是Sequence logo (圖四) 來判斷其胺基酸序列的大致種類。
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