【NGS Introduction Series- Nanopore RNA flow cell 】
Oxford Nanopore從2014年推出了首款的奈米孔測序儀以來，一直不斷地推陳出新；於2017年推出Direct RNA sequencing (DRS)測序方法；2019年發佈了新一代的R10測序晶片；2022年推出全新的V14試劑組搭配最新的R10.4.1測序晶片使用，同時更新升級DRS試劑組及測序晶片，原本DRS使用的晶片為與DNA測序所共用，升級後則為專門搭配DRS試劑組使用的RNA測序晶片。
Nanopore利用將蛋白質奈米孔嵌在具有電阻性的聚合物膜中，在膜上施加電壓形成電流通過奈米孔。RNA分子經由建庫後，接在RNA上的動力蛋白(Motor protein)會引導單股RNA穿過奈米孔蛋白，當不同的鹼基通過奈米孔時會造成電流擾動，引起不同程度的電流變化，藉由測定電流變化來辨識RNA序列。
R10版本的晶片採用全新設計的奈米孔蛋白，採用延長的構造中帶有雙讀取器，讀取器為對鹼基進行判定的結構；舊的R9晶片只有一個讀取器，無法精準辨識連續相同鹼基的序列。當RNA通過R10晶片的奈米孔時，會對同一鹼基進行二次判定，能夠大幅提升R9晶片的測序準確度至99%。升級後的DRS晶片除了具有上述的R10晶片特性外，奈米孔蛋白改良為RP4 Nanopore，試劑組中的動力蛋白也同步改為可與RP4專一作用的蛋白分子，藉此提高DRS的效率。
另外，與DNA測序不同的是，RNA分子通過奈米孔的方向為3’端往5’端移動，最後進行basecalling的分析演算法會自動將資料進行轉換，使序列以5’→3’方向呈現。總結來說，目前的DRS試劑組 (SQK-RNA004)搭配測序晶片 (FLO-PRO004RA)，再加上sup-v5.0.0 basecalling演算法，使得RNA定序的準確度由Q14.5提升至Q18.8，DRS在Nanopore平台不僅有獨特性，加上不斷優化的準確性，在未來的應用及發展上應該具有高潛力的可看性！
Next Generation Sequencing (NGS) Sequencing Service
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