組織切片染色是一種在顯微鏡下觀察組織或細胞結構的技術，將組織切片染色，增強不同結構的對比度，使得研究者能夠透過顯微鏡更清楚地分辨細胞的形態、位置與結構差異。以下為臨床常見的染色方法:

(1) 蘇木精-伊紅染色（H&E stain）

蘇木精（Hematoxylin）是一種鹼性染劑，對酸性結構（嗜鹼性結構）具有親和力，包括DNA、RNA等核酸，蘇木精能夠藉由與細胞核內的DNA及核糖體中的RNA結合，而使細胞核呈現藍紫色；伊紅（Eosin）是一種酸性染劑，對鹼性結構（嗜酸性結構）具有親和力，包括細胞質中的蛋白質、胞外基質等，伊紅能夠使得細胞質、膠原纖維、紅血球等結構被染成紅色。H&E染色為臨床最常用的染色方法，用於一般組織學觀察，常見於肝臟、腎臟、腫瘤等切片。

(2) 免疫組織化學染色（IHC stain）

免疫組織化學染色（Immunohistochemical stain）是在抗體上結合螢光或可呈色的化學物質，利用抗體與生物組織中的抗原具特異性結合的免疫學原理，能夠用來檢測目標抗原的表現量與位置，並提高病理診斷的靈敏度和特異度。IHC染色常應用於腫瘤組織的標誌物(Bio-Marker)檢測，透過染色判別目標抗原的表現與否，協助臨床醫師挑選適合病人的癌症用藥。

(3) 革蘭氏染色(Gram stain)

革蘭氏染色主要用於細菌檢體。革蘭氏陽性菌的細胞壁厚且主要由多層肽聚糖構成，能使得染色劑牢固地結合在細胞壁上，這類細菌在染色過程中能夠保留結晶紫染劑，即使經過脫色劑（如酒精或丙酮）處理後仍保持紫色；革蘭氏陰性菌的細胞壁較薄，肽聚糖層單薄，且外覆一層脂多醣（LPS）膜，造成染色劑較容易被脫色劑洗脫，這類細菌在染色過程中，第一劑結晶紫染劑會在脫色劑的作用下被洗脫，隨後染上番紅或沙黃染劑而使細菌呈現紅色或粉紅色；革蘭氏染色的結果運用於細菌的鑑定，能夠協助臨床初步判定病人感染的細菌種類，從而選擇適合之抗生素進行治療。

#H&E_Staining

#IHC

#Gram_Staining

#組織切片染色